Wie funktioniert die Systematisierung der Städtenamen mit Flüssen?

Das ist meistens historisch bedingt und unterliegt keinem bestimmten System. Zum Beispiel würden wir heute nicht mehr sagen "Rothenburg ob der Tauber", sondern "an der Tauber", und aus "Stratford upon Avon" wurde auch schon "Stratford on Avon".

Mit dem "über" und "unter" oder "sur" und "sous" hat es eine besondere Bewandtnis, die ist nämlich geographischer Natur: Was "darüber" ist bestimnmt die Landschaft. Das geht nicht nach Himmelsrichtungen oder GPS-Koordinaten, sondern nach den Bergen und Tälern. Und oftmals auch nach Siedlungen, die nicht mehr existieren: Ein "village-sous-chateau" kann den Namen noch tragen lange nachdem es das Schloss nicht mehr gibt.